B016947 - BIOLOGIA MOLECOLARE E APPLICAZIONI BIOINFORMATICHE

italiano

Regolazione dell'espressione genica negli eucarioti e tecniche per la valutazione dell' espressione genica. Aspetti molecolari dei fondamentali processi biologici. proliferazione, differenziamento, morte e motilità cellulare. Principali tecniche utilizzate nella valutazione di tali processi.
Banche dati di interesse biotecnologico. Allineamenti di sequenze. Informazione negli allineamenti mutipli. Ricerca di fattori di trascrizione e bersagli di microRNA. Gene finding.

Alberts l'essenziale di biologia molecoalre della cellula ; Darnell, Lodish: Biologia molecolare della cellula Ed. Zanichelli
T.A. Brown "Genomi" Ed. Edises
Lewin Benjamin; Il gene VIII; Ed. Zanichelli
J. Watson,Biologia Molecolare del Gene . Ed. Zanichelli
Introduzione alla Genomica”
Gibson e Muse; Zanichelli.
Griffith-Zanichelli- Genetica-Principi di analisi Formale
Hartwell- McGraw-Hill- Dall’analisi formale alla genomica
"Fondamenti di Bioinformatica" Citterich et al. Zanichelli

Conoscenza di: terminologia usata in biologia molecolare e cellulare. Basi molecolari dei processi coinvolti nella crescita, morte, adesione e motilità cellulare e fattori coinvolti nella regolazione; basi di biologia cellulare e molecolare relative al controllo della segnalazione cellulare coinvolta nei processi biologici fondamentali Elementi di Bioinformatica

Conoscenze di Biologia e Biochimica

CFU: 6
Numero di ore totali del corso: 52
Numero di ore relative ad attività di laboratorio (lezioni in laboratorio informatica): 12
Numero di ore relative ad attività di esercitazioni (in laboratorio e in campo):
Numero di ore relative ad attività seminariali: 0
Numero di ore per prove in itinere:

La strumentazione in dotazione presso il dipartimento di scienze biomediche Sper e Clin (sezione biochimica) è usata per effettuare lezioni, dimostrazioni ed esercitazioni pratiche di bioinformatica

La verifica dell'apprendimento sarà eseguita mediante colloquio orale in cui sarà valutata sia la capacità dello studente di muoversi all'interno del programma sia la loro capacità di affrontare problematiche di tipo biotecnologico.

Controllo dell'espressione genica negli eucarioti: struttura dei promotori trascrizionali e fattori trascrizionali regolativi. Modificazioni della cromatina (rimodellatori della cromatina, swi/sfn, proteine HMG). Regolazione semipermanente e permanente dell'espressione genica (circuiti autoregolativi coinvolti nel differenziamento cellulare). Silenziamento genico e microRNA. Morte cellulare programmata: apoptosi ed autofagia. Molecole coinvolte nell'adesione cellulare: struttura e funzione. Il citoscheletro: struttura e ruolo nella motilità, migrazione cellulare e regolazione dell'espressione genica. Comunicazione cellulare: giunzioni di tipo gap. Metodologie per lo studio della regolazione dell'espressione genica e dei processi biologici quali proliferazione, adesione, motilità, differenziamento, morte cellulare.
Banche dati in genomica, trascrittomica e controllo dell’espressione genica. Teoria e pratica degli allineamenti. Informazione negli allineamenti multipli: motivi, firme, fingerprints, profili, modelli di Markov. Metodi per l’idetificazione di siti di legame di fattori di trascrizione. Metodi per i bersagli dei microRNA. Isole CpG, promotori e gene finding.