Principi e applicazioni delle seguenti tecnologie: Tecnologie di genomica- tecnologie di sequenziamento ad alta produttività; Tecnologie trascrittomicche - Tecnologia Affymetrix, Tecnologia Illumina; Tecnologie per la proteomica - tecnologie di microarray solide e liquide, tecnologie di spettrometria di massa; Tecnologie metabolomiche - tecnologie di spettrometria di massa e tecnologie di risonanza nucleare magnetica. Principi di base dei comuni strumenti analitici.
Scopo del corso è quello di formare gli studenti sui metodi chimici e biochimici avanzati nelle scienze 'omiche'. In questo corso, infatti, gli studenti apprenderanno i principi base delle tecnologie genomica, trascrittomica, proteomica, metabolomica. Faranno parte del corso anche metodi statistici per l'analisi e l'integrazione dei dati, per aiutare nell'interpretazione dei dati –omici prodotti. Il corso illustrerà come questi dati "omici" possono essere applicati e adattati per rispondere alle principali domande in biomedicina e in altri campi di ricerca.
Prerequisiti
nessuno
Metodi Didattici
lezioni frontali e attività formative professionalizzanti
Altre Informazioni
Per informazioni contattare per email
Prof Anna Maria Gori
annamaria.gori@unifi.it
Prof. Leonardo Tenori
tenori@cerm.unifi.it
Prof. Elena.sticchi@unifi.it
Modalità di verifica apprendimento
Test orale con domande relative a tutti gli argomenti trattati nelle lezioni frontali
Programma del corso
Lezioni frontali (32 h)
Principi e applicazioni delle seguenti tecnologie: Tecnologie di genomica- tecnologie di sequenziamento ad alta produttività; Tecnologie trascrittomicche - Tecnologia Affymetrix, Tecnologia Illumina; Tecnologie per la proteomica - tecnologie di microarray solide e liquide, tecnologie di spettrometria di massa; Tecnologie metabolomiche - tecnologie di spettrometria di massa e tecnologie di risonanza nucleare magnetica. Principi di base dei comuni strumenti analitici.
Esercitazioni di laboratorio (24 h): Esempio di software e strumenti bioinformatici per l'analisi e l'interpretazione di dati di genomica e trascrittomica. Estrazione del DNA per High Throughput Sequencing (HTS). Preparazione di campioni per analisi di espressione genica. Preparazione di campioni per genomica e trascrittomica. Preparazione del campione, acquisizione dei dati mediante strumento NMR a 600 MHz, elaborazione degli spettri mediante software Amix e Topspin, analisi dei dati mediante l'ambiente statistico "R".