Concetti di base in campo evolutivo. Principali processi evolutivi a carico delle sequenze biologiche. Tecniche per lo studio dei processi evoutivi. Sviluppo e ricostruzione di modelli evolutivi. Analisi di casi studio reali.
Graur and Li, Fundamentals of molecular evolution , Sinauer 2000
Michael Michael Lynch, The Origins Origins of Genome Architecture , Sinauer 2007
Obiettivi Formativi
Conoscenze: Il corso intende fornire agli studenti le basi concettuali e tecniche nell’ambito della evoluzione molecolare.
Competenze e capacità acquisite:
gli studenti apprenderanno le principali teorie alla base dello studio dell’evoluzione delle sequenze biologiche. Inoltre,
gli studenti acquisiranno le competenze teoriche relative alle principali metodologie in ambito computazionale per lo studio dell’evoluzione dei sistemi biologici. Saranno inoltre illustrate le loro potenziali mediante l’analisi di casi studio reali.
Frequenza delle lezioni:
la frequenza è fortemente consigliata.
Strumenti a supporto della didattica: Diapositive delle lezioni; articoli scientifici
Orario di ricevimento: a discrezione dello studente
Modalità di verifica apprendimento
Esame orale
Programma del corso
Introduzione: definizioni, storia, campi di studio e di applicazione. Le componenti di base che costituiscono la vita . Teorie sull’origine della vita.
Processi microevolutivi: i geni nelle popolazioni, mutazione, selezione, deriva, ricombinazione. Cambiamenti evolutivi nelle sequenze nucleotidiche. La duplicazione genica e l’espansione dei genomi. Ortologhi e paraloghi. Architettura ed evoluzione del genoma, evoluzione del genoma.
Tecniche computazionali in evoluzione molecolare. Modelli e tassi di sostituzione nucleotidica. Filogenesi molecolare. Metodi di distanza e di probabilità.
Il trasferimento genico orizzontale e elementi mobili Tecniche per l’individuazione del trasferimento genico orizzontale.